Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms