Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Col26a1Q91VF6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col26a1Q91VF6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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