Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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