Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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