Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms