Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lrit1Q8K099 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lrit1Q8K099 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lrit1Q8K099 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lrit1Q8K099 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrit1Q8K099 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms