Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsnQ8CIT9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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