Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms