Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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