Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Snx8Q8CFD4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Snx8Q8CFD4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Snx8Q8CFD4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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