Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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