Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms