Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms