Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc90bQ8C3X2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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