Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms