Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms