Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PgghgQ8BP56 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms