Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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