Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tspan9Q8BJU2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan9Q8BJU2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms