Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms