Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms