Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms