Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms