Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms