Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Topbp1Q6ZQF0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms