Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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