Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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CltbQ6IRU5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms