Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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