Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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