Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms