Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrmQ64674 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SrmQ64674 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms