Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms