Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms