Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms