Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TmpoQ61033 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms