Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms