Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms