Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms