Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm11487Q5RIS0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm11487Q5RIS0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm11487Q5RIS0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm11487Q5RIS0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm11487Q5RIS0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm11487Q5RIS0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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