Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms