Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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