Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam220aQ3ZN08 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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