Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms