Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms