Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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