Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms