Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pfdn4Q3UWL8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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