Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chpf2Q3UU43 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms