Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fchsd2Q3USJ8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms