Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm28047Q3US59 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm28047Q3US59 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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